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Son équipe est à l'origine de la création de quelques start-ups [ 12 ]. Il bénéficie de l'aide de l' Union européenne et du Fonds européen de développement régional ainsi que de nombreux partenariats [ 21 ]. Didier Raoult s'est investi dans la microbiologie clinique [ 22 ] , [ 23 ].

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Elle a proposé un traitement spécifique des endocardites à hémocultures négatives [ 29 ] et présente également une nouvelle référence dans la prise en charge des endocardites [ 30 ]. La découverte des virus géants remet profondément en cause la classification des virus. En , l'équipe en collaboration avec des chercheurs français, brésiliens et suédois, découvre deux souches de nouveaux virus géants, les Tupanvirus , les virus les plus longs de la virosphère actuellement connue, et qui présentent une nouvelle étape vers la compréhension du monde des virus géants [ 43 ].

Depuis les années , il a identifié et décrit avec son équipe une centaine de nouvelles bactéries pathogènes [ 44 ]. Avec son équipe, il a identifié 10 nouvelles espèces de Rickettsies pathogènes pour l'homme. Le laboratoire est un Centre national de référence partenariat avec l' Institut de veille sanitaire et Centre collaborateur de l'OMS. Pour les Bartonellas , l'équipe a été la première à identifier leur rôle dans les endocardites [ 49 ]. Pour la fièvre Q , maladie transmise par l'agent bactérien Coxiella burnetii , il a été amené à en redéfinir les critères de diagnostic, à décrire tous les aspects de la maladie et à mettre en évidence le rôle de la bactérie dans la genèse des lymphomes non hodgkiniens [ 50 ].

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Il a mis en évidence, avec son équipe, le rôle des anticorps anti-phospholipide dans les endocardites à Coxiella burnetii [ 51 ] et dans les thromboses. Il a récemment décrit les endocardites aiguës [ 52 ] et redéfini les endocardites persistantes. Tropheryma whipplei , l'agent causal de la maladie de Whipple , décrite en par le docteur Georges Hoyt Whipple , a été isolé pour la première fois dans le laboratoire de Didier Raoult [ 54 ]. Son équipe est une des deux équipes mondiales à avoir séquencé le génome de la bactérie [ 55 ]. La découverte de Tropheryma whipplei a montré que la bactérie est relativement commune dans l'environnement ou sur les muqueuses des patients, sans nécessairement être associée à la pathologie [ 56 ].

Pour la maladie de Whipple il a mis en place le traitement devenu le traitement de référence par doxycycline et hydroxychloroquine [ 57 ] et décrit les formes aiguës de la maladie qui incluent les pneumopathies [ 58 ]. Ces techniques ont également conduit à la mise en évidence de la cause de la mort d'une partie des soldats de l'armée de Napoléon I er au cours de la retraite de Russie à partir des fosses communes découvertes à Vilnius [ 63 ].

En , Didier Raoult décide de démarrer un nouveau programme de génomique et de l'appliquer à la microbiologie et aux maladies infectieuses. L'équipe a commencé avec Rickettsia conorii [ 64 ]. Cette nouvelle approche de la biodiversité est appliquée aux microbiotes humains.

De fait, cette approche du microbiote digestif a amené à repenser le rôle du microbiote dans la malnutrition [ 69 ]. Didier Raoult développe actuellement, en collaboration avec d'autres équipes, des recherches sur les relations entre microbiote et cancer , en particulier sur les modifications du système immunitaire selon la composition du microbiote intestinal [ 72 ] , [ 73 ].

En effet, la structure du microbiome peut induire des modifications du système immunitaire et moduler la pharmacodynamique des médicaments chimiothérapeutiques et ainsi la réponse des malades aux thérapies [ 66 ]. L'un des champs de recherche développé par Didier Raoult est très controversé, mais représente selon lui une question majeure de santé publique. Il concerne les manipulations de la flore intestinale et l' obésité [ 74 ]. Le professeur Didier Raoult intervient régulièrement dans les médias.

Il consacre son ouvrage Votre santé à cette question [ 82 ]. Elle fait l'objet de nombreuses mises en garde [ 90 ] , en raison de nombreux échecs à traiter d'autres virus suite à des résultats in vitro pourtant prometteurs, de l'absence de données cliniques et de contre-indications, effets secondaires, risques de surdosage et problèmes d'interactions médicamenteuses connus [ 85 ] , [ 91 ]. Le 11 mars , Didier Raoult devient l'un des onze experts choisis pour faire partie du conseil scientifique Covid , chargé d'éclairer les décisions à prendre par les autorités pour lutter contre la pandémie en France [ 93 ].

Ne participant plus aux réunions, il dit refuser d'en démissionner le 24 mars [ 94 ]. Il se positionne rapidement à contre-courant de la politique de faible dépistage et se désolidarise des mesures de confinement prises en France [ 95 ] , jugeant que la mortalité due à la maladie est peu significative eu égard à sa faible létalité enregistrée, et qui porte dans sa zone géographique PACA uniquement sur deux personnes de plus de 87 ans pour cas confirmés.

Il blâme l'intense surmédiatisation du virus sans base scientifique, en comparant ces chiffres ou ceux du Diamond Princess [ 96 ]. Le 16 mars , il diffuse une vidéo enregistrée devant ses étudiants dans laquelle il annonce les résultats positifs de sa propre étude clinique [ 85 ] , [ 97 ] , [ 98 ] , qui seront publiés le 20 mars cf infra.

Selon toute vraisemblance il fait référence et a été influencé par les travaux de Didier Raoult [ ]. Son protocole et ses modalités de publication sont fortement critiquées par la communauté scientifique [ 3 ] , [ ] , [ ] , [ ] , par le conseil scientifique sur le Covid [ ] , et commentées sur le site Pubpeer [ ]. L'équipe de Raoult annonce le 22 mars qu'elle proposera à tous les patients infectés un traitement en associant l'hydroxychloroquine et l'antibiotique azithromycine , hors AMM [ ] , [ ].

En , Didier Raoult publie un article où il fait part de son scepticisme face aux modèles mathématiques de prédiction du climat [ ]. Il dit notamment que les modèles mathématiques sont la version moderne de la divination. Dans un communiqué de presse du 23 novembre , la CGT-FERC dénonce des pratiques de gestion du personnel bien ancrées, à l'origine du mécontentement de certains membres du personnel, citant, encore une fois, le manque de reconnaissance envers les personnels techniques, dont l'avis et l'expertise sont souvent ignorés, ou encore des décisions prises unilatéralement et en dehors de toute règle élémentaire d'hygiène et de sécurité.

En particulier, ce communiqué souligne qu'à la connaissance du syndicat, au moins six femmes ont eu à subir, au sein de l' Urmite , des faits de harcèlement sexuel, et dénonce que Didier Raoult n'aie ni fait remonter les faits à sa hiérarchie conformément à l'article 40 , ni même séparé la victime de son agresseur, installées dans des laboratoires contigus [ ].

Didier Raoult nie la présence de tout climat malsain au sein de son unité. D'après lui, ces accusations seraient le résultat d'une minorité de détracteurs, jaloux du succès du l'IHU [ ] , [ ]. En ce qui concerne les accusations de harcèlement et agressions sexuelles, il affirme avoir réglé le problème et dénonce que le CNRS aie voulu rendre justice lui-même en révoquant le chercheur accusé de harcèlement [ ].

Après enquête, les CHSCT de l'Inserm, du CNRS, de l'université d'Aix-Marseille, et de l' Institut de recherche pour le développement IRD confirment les faits dénoncés par le personnel de l'unité, mentionnant notamment un harcèlement quotidien de la part de Didier Raoult et de ses collaborateurs, des conditions de travail déplorables, au niveau des amplitudes de travail, des locaux et des rapports hiérarchiques, ainsi que des manquements graves et répétés aux règles de sécurité, pourtant extrêmement strictes en ce qui concerne les agents pathogènes manipulés dans ce genre d'installations [ ] , [ ].

Didier Raoult est classé parmi les dix premiers chercheurs français par la revue Nature pour le nombre de publications plus de deux mille à son actif comme pour le nombre de citations reprenant ses travaux [ 13 ]. Rien que pour l'année , il signe publications, soit une tous les deux jours environ.

Il y apparaît comme l'un des 99 microbiologistes mondiaux et l'un des 73 scientifiques français les plus hautement cités [ ] , [ ]. Il fait également partie de la liste des auteurs les plus cités du domaine biomédical [ ]. Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.

Pour les articles homonymes, voir Raoult. Didier Raoult. Michel Laurent.

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Virologue , microbiologiste , infectiologiste. Microbiologie , infectiologie. Conseil scientifique Covid Cette section est trop longue. Elle pourrait gagner à être raccourcie ou répartie en plusieurs sous-sections. Il est également possible que sa longueur crée un déséquilibre dans l'article, au point d'en compromettre la neutralité en accordant à un aspect du sujet une importance disproportionnée. What does the future hold for clinical microbiology? Nat Rev Microbiol. Modern clinical microbiology: new challenges and solutions.

J Clin Microbiol.

Ongoing revolution in bacteriology: routine identification of bacteria by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Clin Infect Dis. Point-of-care testing for community-acquired pneumonia.

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Lancet Infect Dis. Clin Microbiol Rev. Comprehensive diagnostic strategy for blood culture-negative endocarditis: a prospective study of new cases. Evaluation of empirical treatment for blood culture-negative endocarditis. J Antimicrob Chemother.

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International experts' practice in the antibiotic therapy of infective endocarditis is not following the guidelines. Clin Microbiol Infect. Viral communities associated with human pericardial fluids in idiopathic pericarditis. PLoS One. Provirophages and transpovirons as the diverse mobilome of giant viruses.

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